El reino subacuático de Boracay alberga más de 270 especies de coral documentadas, distribuidas en 12 sitios de buceo mapeados que rodean las costas sur y este de la isla.
El censo de 2024 de la Philippine Reef and Marine Foundation contó 487 especies de peces dentro de las zonas de santuario marino protegido de la isla, una densidad de biodiversidad que sitúa a Boracay entre las zonas costeras más ecológicamente importantes de las Bisayas Occidentales. Las temperaturas del agua se mantienen estables entre 27 y 29 grados centígrados durante todo el año, eliminando el choque térmico que complica el buceo tropical en otros lugares del Sudeste Asiático.
La infraestructura de buceo de la isla se expandió rápidamente después de que la rehabilitación ambiental de 2018-2019 cerrara la isla al turismo durante seis meses. Cuando Boracay volvió a abrir, los nuevos sistemas de tratamiento de aguas residuales y los protocolos de amarre estrictamente aplicados reemplazaron las prácticas de anclaje que habían dañado el 40 por ciento de la cobertura de coral cercana a la costa. El éxito más visible de la rehabilitación apareció en Crocodile Island, un afloramiento de piedra caliza de 200 metros a dos kilómetros al sur de White Beach, donde la cobertura de coral duro aumentó del 22 por ciento en 2018 al 61 por ciento en 2023. La visibilidad promedia ahora de 15 a 25 metros durante la temporada seca de noviembre a mayo, cuando los vientos monzónicos del noreste se calman y las floraciones de plancton disminuyen.
Discover scuba diving Boracay opera bajo un modelo de certificación por niveles. El programa introductorio de un día limita a los participantes a profundidades de entre 6 y 12 metros, un rango que abarca los jardines de coral más accesibles de la isla y la mayoría de su fauna marina residente. Los participantes completan una sesión de 30 minutos en piscina o aguas confinadas en una instalación frente a la playa antes de trasladarse a un sitio de acceso en barco. El curso SSI Basic Diver extiende el plan de estudios de aguas poco profundas a dos días, añadiendo habilidades de navegación y perfeccionamiento de la flotabilidad. Ambos programas despliegan instructores certificados por PADI o SSI que mantienen una proporción máxima de cuatro estudiantes por instructor, un estándar que supera el promedio regional. El buceo con casco, una alternativa sin certificación, utiliza aire suministrado desde la superficie y cascos de latón pesados para caminar con los participantes a lo largo de un canal de arena de seis metros poblado por peces sargento, peces loro y ocasionales tortugas carey. La actividad no requiere habilidad de natación y acomoda a huéspedes desde los ocho años de edad, aunque el peso de 18 kilogramos del casco limita la duración de la sesión a 20 minutos. Las inspecciones de equipo se realizan diariamente, y todo el aire comprimido proviene de sistemas de filtración certificados según los estándares europeos de aire respirable EN 12021.
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